Para llegar a a la caseta del parque Natural debes ir por la AP-7 dirección Francia y salir en Figueres. De allí seguir los indicadores a Roses y Sant Pere Pescador. Encontrarás los desvíos indicados a Empuriabrava y al parque después de pasar varias rotondas.

Dentro del Parque Natural de los Aiguamolls del Empordà encontramos una serie de senderos bien señalizados con numeroso puntos de interés.

Itinerario 1: desde El Cortalet hasta El mas del Matar Este es un itinerario breve pero intenso, que permite disfrutar de una muestra muy completa, accesible y amena de buena parte de los hábitats y las especies más emblemáticas del Parque. Aunque se trata de un recorrido corto, los numerosos observatorios permiten alargar la vista y observar la gran variedad de aves que encuentran refugio en la zona durante todo el año. Ida y vuelta por el mismo camino. De El Cortalet a El mas del Matar hay 2,5 km (GR92).

Itinerario 2: de El mas del Matar a Les Llaunes. Este itinerario permite conocer parte de la franja litoral del Parque Natural, desde los estanques de aguas dulces y poco profundas, a El mas del Matar, y hasta la playa, rodeando la laguna litoral de La Massona. Los numerosos observatorios del itinerario y la altísima torre Senillosa permiten tener una visión excelente de la fauna, los hábitats y buena parte de la geografía de la comarca. Ida y vuelta por el mismo camino o bien siguiendo el itinerario 3 (Vuelta a la Reserva). De El mas del Matar a la playa hay 2,3 km (GR92).

Itinerario 3: Vuelta a la Reserva Integral de Les Llaunes. Este itinerario es la continuación de los itinerarios 1 y 2. Transcurre a lo largo de la franja litoral de la Reserva Integral, donde se puede observar prácticamente intacta la vegetación de suelos arenosos y salinos. A lo largo del recorrido encontraremos unas torres de observación que nos permitirán observar la diversidad ambiental de las llaunes.  Este itinerario nos permite dar la vuelta a la Reserva Integral, hasta regresar al punto de origen (8,2 km).El tramo de la playa permanecerá cerrado del 1 de abril al 1 de julio por ser época de nidificación

Itinerario 4: de El Cortalet a los Estanques Europa. Este itinerario enlaza dos espacios húmedos creados por el Parque Natural y a la vez conecta El Cortalet con Empuriabrava. Atraviesa un trozo de la llanura agrícola desnuda de sombras, y hacerlo a pie puede ser fatigoso si hace calor, pero es interesante todo el año. El último tramo del recorrido bordea los Estanques Europa, de origen artificial y que recogen las aguas limpias de la estación depuradora de aguas residuales (EDAR), y el itinerario termina sobre el puente de madera para peatones que encontramos sobre el río Muga, donde se puede apreciar muy bien el bosque de ribera. Ida y vuelta por el mismo camino o bien enlazando con la Ruta de los Estanques. De El Cortalet a los Estanques Europa hay 4 km.

Itinerario 5: Este itinerario está situado en el margen izquierdo del rio Fluvià, a 1,5 km de su desembocadura, en el municipio de Sant Pere Pescador. Fue adquirida por la Obra Social Catlunyacaixa en el año 1999 y tiene una extensión aproximada de 10 ha. El interés de este itinerario recae en el pasto de corte, que tiene una gran diversidad florística, incluyendo varias especies de orquídeas y una importante fauna asociada. El bosque de ribera aparece en una franja estrecha cerca del rio, en la que poco a poco se está recolonizando una antigua población de chopos y plataneros y constituye una magnífica zona de cria de aves como el oriol o el pito real.